- K.Hasegawa, M.Arakawa, K.Funatsu, 3D-QSAR study of insecticidal neonicotinoid compounds based on 3-way partial least squares model, Chemom. Intell. Lab. Syst., 47, 33-40 (1999).
- K.Hasegawa, M.Arakawa, K.Funatsu, Rational choice of bioactive conformations through use of conformation analysis and 3-way partial least squares modeling, Chemom. Intell. Lab. Syst., 50, 253-261 (2000).
- 荒川 正幹, 長谷川 清, 船津 公人, 4way PLS法を用いた活性コンフォメーションと重ね合わせルール選択手法 -タンパクの3次元構造によるバリデーション, Journal of Computer Aided Chemistry, 1, 1-7 (2000).
- 荒川 正幹, 長谷川 清, 船津 公人, 4way PLS法を用いた活性コンフォメーションと重ね合わせルール選択手法 -外部予測によるバリデーション, Journal of Computer Aided Chemistry, 1, 8-14 (2000).
- 松岡 成郎, 長谷川 清, 荒川 正幹, 船津 公人, Kohonenネットワークと3wayPLS法を用いた新しい3D-QSAR手法の開発, Journal of Computer Aided Chemistry, 1, 22-34 (2000).
- 棚田 東作, 荒川 正幹, 西村 竜一, 船津 公人, ケモメトリックス手法を用いた材料開発支援プログラムの開発, Journal of Computer Aided Chemistry, 1, 35-46 (2000).
- 荒川 正幹, 長谷川 清, 船津 公人, Hopfield Neural Networksを用いた新しい分子重ね合わせ手法, Journal of Computer Aided Chemistry, 2, 29-36 (2001).
- K.Hasegawa, S.Matsuoka, M.Arakawa, K.Funatsu, New molecular surface-based 3D-QSAR method using kohonen neural network and 3-way PLS, Computers and Chemistry, 26, 583-589 (2002).
- 荒川 正幹, 長谷川 清, 船津 公人, Hopfield Neural Networkを用いた新しい分子重ね合わせ手法の3D-QSARへの応用, Journal of Computer Aided Chemistry, 3, 63-72 (2002).
- 荒川 正幹, 長谷川 清, 船津 公人 , Hopfield Neural Networkを用いた新しい分子重ね合わせ手法の3D-QSARへの応用 - HER2阻害剤の解析 -, Journal of Computer Aided Chemistry, 3, 99-106 (2002).
- K.Hasegawa, M.Arakawa, K.Funatsu, Simultaneous determination of bioactive conformations and alignment rules by multi-way PLS modeling, Computational Biology and Chemistry, 27, 211-216 (2003).
- K.Hasegawa, S.Matsuoka, M.Arakawa, K.Funatsu, Multi-way PLS modeling of structure-activity data by incorporating electrostatic and lipophilic potentials on molecular surface, Computational Biology and Chemistry, 27, 381-386 (2003).
- M.Arakawa, K.Hasegawa, K.Funatsu, Novel alignment method of small molecules using Hopfield Neural Network, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 43(5), 1390-1395 (2003).
- M.Arakawa, K.Hasegawa, K.Funatsu, Application of novel molecular alignment method using Hopfield Neural Network to 3D-QSAR, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 43(5), 1396-1402 (2003).
- 荒川 正幹, 長谷川 清, 松岡 成郎, 船津 公人, 分子表面上の静電・疎水ポテンシャルを用いたMulti-way PLSモデリング, Journal of Computer Aided Chemistry, 4, 18-26 (2003).
- 荒川 正幹, 船津 公人, 多次元データモデリングソフトウェアの開発, J. Comput. Chem. Jpn., 3, 77-84 (2004).
- K.Hasegawa, M.Arakawa, K.Funatsu, Novel Computational Approaches in QSAR and Molecular Design Based on GA, Multi-way PLS and NN, Current Computer-Aided Drug Design, 1, 129-145 (2005).
- 荒川 正幹, 船津 公人, 後藤 尚弘, ゼロエミッション・シミュレータの開発, 環境科学会誌, 18(1), 29-40 (2005).
- 荒川 正幹, 山田 吉朗, 船津 公人, 原子団寄与法を利用した自動構造生成プログラムの開発, Journal of Computer Aided Chemistry, 6, 90-96 (2005).
- M.Arakawa, K.Hasegawa, K.Funatsu, QSAR study of anti-HIV HEPT analogues based on multi-objective genetic programming and counter-propagation neural network, Chemom. Intell. Lab. Syst., 83, 91-98 (2006).
- 荒川 正幹, 船津 公人, 分子設計のための統合システムToMoCoの開発, J. Comput. Chem. Jpn., 5, 119-128 (2006).
- 河村 智史, 荒川 正幹, 船津 公人, 遺伝的アルゴリズムを用いた波長領域選択手法の開発, Journal of Computer Aided Chemistry, 7, 10-17 (2006).
- 植村 圭祐, 荒川 正幹, 船津 公人, ケモインフォマティックス手法による新規触媒候補の提案, Journal of Computer Aided Chemistry, 7, 69-77 (2006).
- M.Arakawa, K.Hasegawa, K.Funatsu, The recent trend in QSAR modeling - variable selection and 3D-QSAR methods, Current Computer-Aided Drug Design, 3, 254-262 (2007).
- Y.Takahata, M.Arakawa, K.Funatsu, M.C.A.Costa, M.Segala, Core Electron Binding Energy (CEBE) as Descriptors in Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) Analysis of Cytotoxicities of a Series of Simple Phenols, QSAR & Combinatorial Science, 26, 378-384 (2007).
- 金子 弘昌, 荒川 正幹, 船津 公人, 独立成分分析と遺伝的アルゴリズムを用いた新規回帰分析手法の開発, Journal of Computer Aided Chemistry, 8, 41-49 (2007).
- H.Kaneko, M.Arakawa, K.Funatsu, Development of a New Regression Analysis Method Using Independent Component Analysis, J. Chem. Inf. Modell., 48(3), 534 -541 (2008).
- M.Arakawa, K.Hasegawa, K.Funatsu, Tailored Scoring Function of Trypsin-Benzamidine Complex Using COMBINE Descriptors and Support Vector Regression, Chemom. Intell. Lab. Syst., 92, 145-151 (2008).
- M.Koyama, K.Hasegawa, M.Arakawa, K.Funatsu , Application of Rough Set Theory to High Throughput Screening Data for Rational Selection of Lead Compounds , Chem-Bio Informatics Journal, 8, 85-95 (2008).
- 長谷川 清, 光山 倫央, 荒川 正幹, 船津 公人, Rough Set Theoryによるルールマイニングと構造活性相関への応用, Journal of Computer Aided Chemistry, 9, 1-7 (2008).
- 荒川 正幹, 宮尾 知幸, 船津 公人, ドラッグライクネスモデルの構築とその可視化, Journal of Computer Aided Chemistry, 9, 70-80 (2008).
- H.Kaneko, M.Arakawa, K.Funatsu, Development of a new soft sensor method using independent component analysis and partial least squares, AIChE Journal, 55, 87-98 (2009).
- K.Hasegawa, M.Koyama, M.Arakawa, K.Funatsu, Application of data mining to quantitative structure-activity relationship using rough set theory, Chemom. Intell. Lab. Syst., 99, 66-70 (2009).
- 金子 弘昌, 荒川 正幹, 船津 公人, 高精度ソフトセンサー開発のための独立成分分析とサポートベクターマシンを組み合わせた新規異常値検出手法の提案, 化学工学論文集, 35(4), 382-389 (2009).
- 後藤 俊, 荒川 正幹, 船津 公人, ポリマー設計のための物性推算法と逆解析手法の開発, Journal of Computer Aided Chemistry, 10, 30-37 (2009).
- 安藤 正哉, 荒川 正幹, 船津 公人, 可視および近赤外スペクトルを用いた土壌成分値予測モデルの構築, Journal of Computer Aided Chemistry, 10, 53-62 (2009).
- 山城 直也, 宮尾 知幸, 荒川 正幹, 船津 公人, 二酸化炭素吸収液のためのアルカノールアミン構造の設計, Journal of Computer Aided Chemistry, 10, 96-103 (2009).
- 橘 隆一, 熱田 洋一, アヌグラ ウィディヤント, 蒲原 弘継, 後藤 尚弘, 荒川 正幹, 船津 公人, 藤江 幸一, バイオマス・ネットワーク設計ソフトウェア "AB-NET"の開発, 環境科学会誌, 22(4), 257-269 (2009).
- T.Miyao, M.Arakawa, K.Funatsu, Exhaustive Structure Generation for Inverse-QSPR/QSAR, Molecular Informatics, 29, 111-125 (2010).
- L.S.Veras, M.Arakawa, K.Funatsu, Y.Takahata, 2D and 3D QSAR studies of the Receptor Binding Affinity of Progestins, Journal of the Brazilian Chemical Society, 21, 872-881 (2010).
- T.Takahashi, M.Arakawa, K.Funatsu, Y.Ema, An autonomous and intelligent modeling system of the calculation process of a CVD film deposition simulator., Journal of chemical engineering of Japan, 43, 977-982 (2010).
- 宮尾知幸, 荒川正幹, 船津公人, 爆発物検出における統合モデルの構築, 安全工学, 49, 11-19 (2010).
- 荒川正幹, 正田幸, 船津公人, 分子構造重ね合わせによるファーマコフォアモデル構築手法の開発とPDE4阻害剤への応用, Journal of Computer Aided Chemistry, 11, 44-55 (2010).
- M.Arakawa, T.Miyao, K.Funatsu, Systematic Generation of Chemical Structures for Rational Drug Design based on QSAR models, Current Computer-Aided Drug Design, 7, 1-9 (2011).
- M.Arakawa, Y.Yamashita, K.Funatsu, Genetic Algorithm-based Wavelength Selection Method for Spectral Calibration, Journal of chemometrics, 25, 10-19 (2011).
- 荒川 正幹, 船津 公人, アンサンブル学習による有機化合物の変異原性予測, Journal of Computer Aided Chemistry, 12, 26-36 (2011).
- 山下 洋輔, 荒川 正幹, 船津 公人, 近赤外スペクトルを用いた果物の内部品質解析, Journal of Computer Aided Chemistry, 12, 37-46 (2011).
- H.Kaneko, M.Arakawa, K.Funatsu, Applicability Domains and Accuracy of Prediction of Soft Sensor Models, AIChE Journal, 57(6), 1506-1513 (2011).
- H.Kaneko, M.Arakawa, K.Funatsu, Novel Soft Sensor Method for Detecting Completion of Transition in Industrial Polymer Processes, Computers & Chemical Engineering, 35(6), 1135-1142 (2011).
- 草場 敏彰, 宮本 真二, 荒川 正幹, 船津 公人, 疑似移動層クロマト分離におけるゼオライト−溶媒選定システムの開発, Journal of Computer Aided Chemistry, 12, 54-64 (2011).
- 山口 耕太, 蒲原 弘継, 後藤 尚弘, 稲吉 辰夫, 荒川 正幹, 船津 公人, 藤江 幸一, 再生瓦製造システムの導入による環境負荷低減効果の評価, 廃棄物資源循環学会論文誌, 22(5), 306-313 (2011).
- T.Takahashi, N.Fukui, M.Arakawa, K.Funatsu, Y.Ema, An Automatic System Using Mobile-Agent Software to Model the Calculation Process of a Chemical Vapor Deposition Film Deposition Simulator, Journal of Nanoscience and Nanotechnology, 11(9), 8004-8008, (2011).
(最終更新日 2012/02/23)